Yayasan Pendidikan Kristen Gloria merupakan organisasi non-profit yang didukung oleh gereja, menjadikan struktur kelembagaannya solid, mulai dari ketua yayasan hingga ke tenaga pengajar. Semuanya disatukan dalam satu visi untuk memberikan pendidikan kristiani yang terbaik bagi anak-anak.

Untuk menunjang operasional yayasan sehari-hari maka pengurus menunjuk Badan Eksekutif (pelaksana) yang bekerja secara intens di kantor yayasan. Badan pelaksana ini terdiri dari orang-orang yang memiliki kemampuan dan profesional di bidangnya. Hal ini menunjukkan bahwa yayasan memiliki sistem manajemen serta pelaksana yang berkompeten.